故事以大雄与小夫以「恐龙是否完全绝种」进行辩论展开序幕，由于认为恐龙仍然存在的主张遭到小夫以科学而合理的方式完全否定，大雄向哆啦A梦寻求帮助，然而当大雄向哆啦A梦所拿出的道具「OX占卜」询问「"地球上"是否还有恐龙活着」时，却得到了否定的答复。之后，为了藏匿大雄零分的考卷，大雄与哆啦A梦使用寻找地底空洞的道具意外发现了宽敞的地下空间，并将之建造成众人的游乐场；但在同时，小夫却因接连在河川、自家后院与地下空间接连目击到恐龙而心烦意乱，烦闷的小夫为了了解真相带着摄影机再度进入地底，却失去了踪迹。大雄与哆啦A梦从小夫失踪前所拍摄的影片得知，地下空间的位置正好位在众人居住城镇河川的下方，于是与胖虎、静香一行人再度潜入，却目击到意外的景象─中生代时代的太古树林塞满了宽广的地底空洞，而理应绝种的恐龙也在出没其中─原来OX占卜虽然正确的回答了问题，但却是依问题的字面意义将搜寻的范围定于「地表」，而掩盖了地表之下有恐龙存在的可能性。哆啦A梦一行在寻找小夫的途中被地底的野蛮民族河童族捕获，正当生命面临危险时，一名乘龙的骑士即时出现救了大家。骑士自称巴赫，并称是地底人国家的骑士，他告知……

美丽富饶的王国阿拉盖西亚，曾经和平欢乐繁荣的领土，却因为邪恶国王(约翰·马尔科维奇饰)的暴政统治活在恐慌的阴影之下。一次意外，普普通通的农家少年…

“龙骑士”的生命是不朽的，可是却对内部的分裂防不胜防。那一代中，一个名叫盖尔巴特瑞克斯的10岁男孩，通过了“龙骑士”最终考验，正式成为他们中的一员。由于无可匹敌的神力，“龙骑士”皆生性傲慢、极度自信，很快就有了自己的龙坐骑的盖尔巴特瑞克斯和两个好友出门旅行，却惨遭围杀，两个好友命丧黄泉，盖尔巴特瑞克斯侥幸逃脱，却永远地失去了本应该伴他终身的伙伴--飞龙。他在荒郊游荡了几个月之后，神智开始越来越混乱，最后被一名农夫发现昏迷在野外……当他回到“龙骑士”的大本营时，就像换了一个人。“龙骑士”的长老觉得盖尔巴特瑞克斯没有资格再获得一条飞龙，这个决定终将他推入了疯狂的深渊，他开始像黑暗力量屈服，私自偷走了一条刚刚孵化出来的小龙，还说服了“龙骑士”中意志最薄弱的莫赞加入自己，两人开始策动向“龙骑士”复仇的大战。后来，又有12名因为各种原因临时倒戈的“龙骑士”，他们组成了“13毁约同盟”，残酷地屠杀“龙骑士”。盖尔巴特瑞克斯成了最后的胜者，他自立为王，用残暴的方式统治整个阿拉盖西亚王国，常年战火纷飞。 　　而我们的小主人公伊拉贡就生活在这个动荡的国度里，从小就被妈妈抛弃的他和叔叔生活在一起，每天以耕种和打猎为生，一天，他在树林里拾到一块泛着蓝光的石头，从此，命运发生了翻天覆地的变化。伊拉贡拾到的是一颗龙蛋，飞龙只有在碰到它真正的主人时才会孵化，当伊拉贡惊奇地看着那只小蓝龙时，还不知道自己注定会成为一名“龙骑士”，一个已经消失了几百年的族类的最后一人。 　　小龙的到来，为和伊拉贡相依为命的叔叔带来了杀身之祸，却也引来了导师布罗姆和精灵公主阿娅的帮助，他们形成了新的同盟，虽然力量非常单薄，却是这个国家惟一的希望。

炎炎夏日，为了找到所向披靡的独角仙，大雄（大原めぐみ 配音）痛哭流涕，对哆拉A梦（水田わさび 配音）软磨硬泡。无奈之下，哆拉A梦和哆拉美（千秋 配音…

风子在偶然的机会下认识了大雄，并被大雄收留成为好朋友。 大雄和多啦A梦带？风子无意间闯进了风之村，这里的人都是利用风从事所有的事情。此时，被封印已久善于利用风做坏事的邪恶岚族的族长乌岚达被唤醒过来，竟然想利用怪物玛风雅征服世界，可爱的风子竟然是怪物玛风雅的一部份，为了拯救世界及风子，大雄及多啦A梦将要一起经历一个不可思议的旅程。

小風在偶然的机会下认识了大雄，并被大雄收留成为好朋友。大雄、哆啦A梦和带小風无意间闯进了风之村，这里的人都是利用风从事所有的事情。此时，被封印已久善于利用风做坏事的岚族邪恶族长乌兰达被唤醒过来，竟然想重新利用怪物馬風卡征服世界，可爱的小風竟然是怪物馬風卡的一部分，为了拯救世界及小風，大雄及哆啦A梦将要一起经历一个不可思议的旅程。

大雄在睡梦中通过粉红色的雾走进一个动物王国，里面人人和平相处，科技发达，是真正的乌托邦！原来动物王国是在遥远的星球，而粉红色之雾是来自未来世界的随意气，是可以用来通往遥远的地方！哆啦A梦回到地球后，收到未来动物星球的求救消息，但随意气已经用完，他们该怎么办呢？ 　在这个绿色的动物星球上，都是些爱好和平的动物们。但和动物星的平行星中，却住着贪婪的人类。于是战争又开始了……

因为玩具机器人，大雄（小原乃梨子 配音）受到小夫（肝付兼太 配音）和胖虎（立壁和也 配音）的奚落，连哆啦A梦（大山のぶ代 配音）不愿帮他。为了寻找生气走掉的哆啦A梦，大雄通过任意门来到寒冷的北极，却在这里发现奇怪的机器人零件。在此之后，各式的零件源源不断从空中掉落至大雄的家中。由于零件过于巨大，为了不引起骚动，两个好友将机器运到镜面世界，并组装成巨大的机器人。他们兴奋地邀请静香（野村道子 配音）来镜面世界玩耍，偶然间发现机器人竟然装备有威力强大的武器。不久，一个名为莉露露（山本百合子 配音）的女孩出现在小镇上，她自称是机器人的主人。大雄他们热心地将镜面世界工具借给莉露露，却发现她在那里建立了毁灭地球的基地……